两均可与一段时间连用，表示"在...之后"，但 after 表示以过去时间为起点的一段时间以后，因此通常与过去时连用；而 in 则表示从现在算起的一段时间以后，因此通常用于将来时或含有将来意义的句子：

He came back after three days. 3天后他回来了。

I'll come back in three days. 我3天后回来。

I think he can come back in three days. 我想他3天后可以回来。

【注】after 除与时间段连用外，还可与时间点连用，此时则可用于将来时(但是in不能与时间点连用)：

He will arrive after five o'clock. 他 5 点钟以后到。

另外，after可以与某些表示活动的名词连用，表示"在...之后"(in不能这样用)：

after school 放学后 after class 下课后

after the meeting 散会后 after liberation 解放后